答：首先，需要明确的是，并不是在《国家税务总局关于企业年金个人所得税征收管理有关问题的通知》（国税函[2009]694号）发布后对于年金才需要缴纳个人所得税。

    根据《财政部、国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费住房公积金有关个人所得税政策的通知》（财税[2006]10号） 第一条规定，企事业单位按照国家或省（自治区、直辖市）人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，免征个人所 得税；个人按照国家或省（自治区、直辖市）人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，允许在个人应纳税所得额 中扣除。

    企业年金是一直不属于国家法定保险，属于补充养老保险的一种形式，对其征税在个人所得税政策上是明确的，在国税函[2009]694号文件发布前，对于年金应按商业保险缴纳个人所得税。

    《财政部、国家税务总局关于个人所得税有关问题的批复》（财税[2005]94号）第一条规定，关于单位为个人办理补充养老保险退保后个人 所得税及企业所得税的处理问题。单位为职工个人购买商业性补充养老保险等，在办理投保手续时应作为个人所得税的“工资、薪金所得”项目，按税法规定缴纳个 人所得税；因各种原因退保，个人未取得实际收入的，已缴纳的个人所得税应予以退回。

    第三条规定，个人实际领（支）取原提存的基本养老保险金、基本医疗保险金、失业保险金和住房公积金时，免征个人所得税。

    《国家税务总局关于单位为员工支付有关保险缴纳个人所得税问题的批复》（国税函[2005]318号）规定，对企业为员工支付各项免税之外 的保险金，应在企业向保险公司缴付时（即该保险落到被保险人的保险账户）并入员工当期的工资收入，按“工资、薪金所得”项目计征个人所得税，税款由企业负 责代扣代缴。

    根据上述规定，在国税函[2009]694号文件发布前，企业为个人所缴纳的年金应按上述规定处理，是需要并入到个人工资薪金中进行缴纳个人所得税的。

    对于年金的缴纳，目前既要考虑调节收入分配，又要体现对企业年金发展给予适当鼓励和扶持的原则。

    因为实施年金的企业毕竟为效益较好企业，而并非如法定保险是普遍适用原则，国税函[2009]694号文件对个人缴费和企业缴费计入个人账 户的部分依法予以征税，防止收入分配差距过大，同时又将企业缴费单独作为一个月工资、薪金计算征收个人所得税（相当于降低了年金的适用税率）。这种处理方 法降低了企业缴费的适用税率，实际上也是一种较为优惠的计算方法，目的是鼓励和扶持企业年金的发展。

    根据国税函[2009]694号第五条规定，“对于通知下发前企业已按规定对企业缴费部分依法扣缴个人所得税的，税务机关不再退税；企业未 扣缴企业缴费部分个人所得税的，税务机关应限期责令企业按以下方法计算扣缴税款：以每年度未扣缴企业缴费部分为应纳税所得额，以当年每个职工月平均工资额 的适用税率为所属期企业缴费的适用税率，汇总计算各年度应扣缴税款。”在于这条规定也体现了对企业以前未缴纳时的一种优惠照顾，即企业不需对其以前未缴纳 的部分按商业保险计算，而可以按照新政策适用较低税率。