随着养殖行业的迅速发展，加上国家大力支持养殖业，使得规模化猪场如雨后春笋般涌现出来。但由于很多养猪户根本就不了解什么是“养猪生物安全”，以至于猪场一旦出现问题只注重治疗，只注重体内病原菌，而不对环境病原菌采取任何措施，导致环境病原菌变异增多，不断地侵入体内造成感染，造成报废性猪场增加。
下面所列为终末生物安全程序的几个步骤：
一、设备和猪舍的清扫、冲洗
清除猪舍内所有的污物、粪便、饲料未、胎衣等。垃圾含有大量的污染物，是主要的传染源。大量的污物也将会降低消毒剂的消毒作用与效果，在冲洗之前务必清扫干净，然后冲洗。
清空猪舍。猪只移出后，拆卸饲槽、保温箱、猪圈隔离物、工具和其他需要移动的及可以移动的设备。
清除污染物。清除粪便、饲料未、污垢等，确保猪舍内尽可能的清洁。
冲洗。清扫完后，用水冲洗猪舍(特别是产房内的漏缝地板、保温箱)、用具、设备等，确保清洁，保证和提高消毒效果。设备晾干后搬回猪舍。
二、消毒前清洁处理
晾干后的猪舍和所有设备都应该清洗，特别是产房和保育舍，清除沉积的污垢和进一步清洁各种设备。
浸泡。用2%火碱清洗。喷射角度为45°(度)角，每平方米喷洒300毫升稀释液，持续浸泡30分钟。
冲洗。从尽可能高的位置开始，一直到最低层或漏缝地板下，用高压水冲洗干净。尤其要注意拐角、保温箱、料槽、饮水器、裂缝和其他污垢沉积的地方。如果有必要，需要擦洗。
晾干。晾干后等待消毒。
三、猪舍和设备消毒
仅仅用冲洗或简单消毒剂进行空舍消毒是不够的，病源的含量、尤其是病毒如果仍高到能对下一批猪产生足够的威胁的话，必须使用广谱消毒剂，对包括病毒、细菌、真菌和其他病原微生物在内的病源进行全面、彻底的消毒才有效。
特别提示给猪场造成巨大危害和经济损失的几种病毒及引发的疾病：
蓝耳病毒(PRRSV)引起的呼吸道与繁殖综合征(PRRS)。
猪瘟病毒(HCV)引起的各种症状的猪瘟。
圆环病毒(PCV-2)引起的子猪断奶衰竭综合征(PMWS)、皮炎肾病综合征(PDNS)。
口蹄疫病毒(FMDV)引起的口蹄疫病。
用欣洁以1∶400稀释液，每平方米喷洒300毫升。
喷雾从顶棚到墙壁，再到地板依次喷洒，直到完全浸润猪舍地表面。
尤其要注意拐角、裂缝和破碎的地方。还要注意清理可渗透的表面，比如木头表面和水泥表面。
特别注意保温箱、漏缝地板及漏缝地板下面要喷洒到消毒液，确保彻底、全面的消毒效果。
自然晾干之后，进猪。
四、喷雾和空气消毒
如果有疫情发生，或感染压力大的话，用“病痊灭”1∶200(0.2%)稀释液对屋檐或其他未消毒区域喷雾消毒后可以立即进猪。
五、供水系统消毒处理
所有的饮水系统都包含有细菌或病源污染物，尤其是水箱、水管或饮水器表面。这些污染物可能会引起疾病，从上一批传染给下一批，交叉传染等。清洁、消毒供水系统有利于预防水污染和由此引发的疾病。
饮水管道系统消毒。用碘福龙1∶200配适量的水，从水箱的顶部倒入，从最远端的饮水嘴开始依次排水，确保整个饮水系统浸泡有碘福龙稀释液。浸泡60分钟以上。
依次从各个饮水器排放，冲洗饮水系统(可以配合使用高压水枪冲洗饮水管道系统，尤其是水嘴)。
饮水消毒。在猪的饮用水中添加0.1%的碘福龙，即碘福龙1∶1000~2000饮水消毒是安全和有效的。
