所有的猪舍都需要不断地通风，以移除猪舍内的热量、水分、灰尘、气体及病原体，发酵床猪舍也不例外，即使在寒冷的黑龙江，这一点也尤为重要。
1 气体流动的原理
气体的流动是有一定的规律的。在无外力的影响下，密度高的气体位于容器的下部，密度小的气体位于容器的上部；气体总是受热后，体积膨胀，密度降低，气体向上运动；气体总是遇冷后体积减小，密度升高，气体向下运动。
2 良好通风的重要因素
一是通过猪舍的气体有一定的流速，二是进入猪舍的气体要均匀地分布到猪舍内的所有区域，并且使新鲜空气与室内的空气充分混合。
3 发酵床猪舍内的气体
发酵床养猪技术是利用微生物的作用，分解猪的粪尿产生大量的热量，同时热量将垫料内的水分蒸发到空气中，通过猪舍的气体交换，完成猪舍内的水汽和热量的移除。
发酵床的发酵是一个耗氧过程，如果猪舍内通风不良，微生物的活动就会受到抑制，分解粪便的能力下降，就会导致发酵床上大量的粪便蓄积，厌氧菌种的活动能力增强，氨气味道加重，猪舍内的二氧化碳的浓度增高等等不利的因素。
携带大量水汽的空气密度小，会不断向猪舍的上方运动，因此，猪舍的排气孔要在猪舍的屋顶。如果猪舍没有排气口，湿热的气体就会在屋顶遇冷凝结成水珠，造成水珠反滴，造成发酵床的水分的二次蒸发，加大了发酵床的工作强度。
气体的交换是一个流动的过程，因此必须要有舍外气体的不断流入猪舍内。在黑龙江，由于年平均气温只有4.5-零下6度，一年中的大多数月份都很冷，猪舍的进气口应该高一些，这样进入猪舍的冷空气可以先与舍内的空气混合后，才到达猪的体表，不会因为冷气直接达到猪的体表而引起猪的疾病。
4 通风的方法
通风换气有两种方法，一是自然通风，二是强制通风。
5 自然通风的设计
自然通风主要是依赖穿越猪舍的气流，也就是要有风的流动。所以猪舍在设计时要充分考虑利用自然通风。要根据猪场的地理位置和当地的气候特点，因地制宜地设计猪舍的通风系统。
⑴ 猪舍要建造在开阔的高处，远离任何挡风的障碍物。
⑵ 猪舍间的距离要较大，这样可以减少不同猪舍间的疾病的传播。
⑶ 猪舍的长轴要与当地的主风向垂直。
⑷ 猪舍的跨度不要超过15米。
⑸ 通风口的设计非常重要。
