在养猪生产中猪的健康状况对利润的影响是巨大的，并且通常在临床疾病爆发的时候影响更大。早期感染会对猪的断奶体重和保育结束时的体重产生负面影响。此外，体重轻的猪在养殖后期易发生疾病。在养猪生产关键阶段（分娩期和保育期）里的一些重要病原菌是：猪葡萄球菌、链球菌、副猪嗜血杆菌、多杀性巴氏杆菌。
在养猪生产的早期阶段，阿莫西林用于治疗由多杀性巴氏杆菌和猪链球菌引起的母猪或仔猪的呼吸道感染。此外，阿莫西林对猪链球菌和副猪嗜血杆菌也有效。氨苄青霉素大致相当于阿莫西林的后继者，它们的杀菌谱和的活性水平。这两种分子都是广谱β-内酰胺类抗生素，其杀菌的作用方式已经被批准用于兽医领域。
在养猪生产中，已经批准使用水溶性和油溶性的注射类产品，同时还有通过饲料或饮水口服的粉剂。下面从实际使用的角度分别介绍每种使用方式的优点和缺点。
注射治疗
注射治疗的主要优点是：
1、 作用快。当猪葡萄球菌和链球菌相关疾病爆发时，关键是让猪尽可能快地获得适当剂量的药物。
2、 更好的生物药效度。几项药代动力学研究表明，肌肉注射阿莫西林后，生物药效度大约是83%，如果使用一种长效制剂，可以有更高的生物药效度。
3、 不受外部因素影响。阿莫西林的药物动力学和稳定性不受饲料摄入量、动物的健康状态、水的pH值或饲料加工方式的影响。
4、 慎重使用抗生素。即使还没有完全证实使用兽用抗生素会在多大程度上导致人类耐药菌株的出现, 但使用注射类产品与口服类产品相比，可导致更少的耐药微生物出现。
然而，肌肉注射也有一些缺点：
1、工作量大。采取注射的方式需要大量的劳动力。
3、 断针头。每次对猪进行注射时都会有将针头弄断在猪体内的一定风险，这将会降低胴体质量，最终导致利润受损。
4、 二手针头。在许多地方，妥善处理用过的针头是一个问题。
拌料治疗
将阿莫西林添加到饲料中使用有两个主要的优点：
2、 一致性。如果一项治疗需要持续几天，将药物添加在饲料中，就会降低漏掉一些猪的概率。
然而，拌料治疗也有一些缺点：
1、作用时间。直到所有的动物都接受到药物治疗，可能需要几天的时间。当疾病爆发时，添加药物的饲料就要开始预订、制造、发送到猪场。最后一点，料罐在投药之前必须是空的。
2、采食量。猪的健康状况将会影响采食量，有一定比例的猪可能没有采食足够的饲料，以至于没有获得足够的药物剂量。
3、制造方面的问题。尽管市场上有不同的产品，阿莫西林分子的稳定性会受到饲料制粒的影响。还有，当饲料混合时通常会出现预混料偏析的现象（译者注，偏析：合金中各组成元素在结晶时分布不均匀的现象称为偏析，此处指饲料混合时很难将抗生素非常均匀地混合到饲料中），导致同一批次的饲料中药物的剂量不相同。
4、肠道微生态失衡的风险。当口服阿莫西林（或其他抗生素）时可能出现肠道生态失调，导致仔猪肠道健康受损。
饮水使用
饮水使用的一些优势和拌料使用类似：
同时，饮水投药也有一些缺点，包括：
1、剂量和治疗的一致性。一般来说饮水投药不如拌料投药的均一性好，但是可以通过改进设备和训练来改善。
2、低pH值。有一些猪场的水源pH值比较低或者使用酸化剂。在酸性的水中阿莫西林的溶解度会受到影响，根据一项研究，它会和柠檬酸反应，形成白色沉淀或结晶。
3、饮水量。猪的健康状况同样会影响饮水量。另外，有证据显示在饮水投药的第一天大肠杆菌引起的腹泻降低了阿莫西林的吸收。
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