要使用国家或农业部指定的正规生物药品厂家生产的疫（菌）苗。要检查疫（菌）苗是否在有效期内，包装有无破损，瓶口、瓶盖是否封严。过期、破损和瓶口封不严的均不得使用。
运输时应注意包装严密，尽量缩短运输时间。由于种类不同，在运输和保存过程中，对其温度要求也不相同。在运输和保存中应避免强光、曝晒、高温造成损坏。应使用正规疫苗运输工具，或装入有冰决的保温瓶或桶内将疫苗运到目的地。途中避免日晒或其他高温。以防疫员经常接触到的禽流感、口蹄疫、猪蓝耳病疫苗为例，最适宜的温度为：2-14℃，长期保存温度为2-8℃；猪瘟疫苗的保存瘟度为：- 15℃。具体情况应仔细阅读各种疫苗的说明书。瓶口开封后的疫苗不能再保存，特别是弱毒疫苗。
严格按说明书规定的方法稀释、注射。首先要做疫苗的真空试验，失去真空的疫苗不要用。现配现用，疫苗加水（或稀释液）以后，应放在冷暗处，疫苗应在稀释后1－2小时内用完，稀释1小时后至3小时内用量要加倍，饮水免疫应在2小时内饮完，其他疫苗也应稀释后及时使用，至迟当天用完，否则应废弃，具体情况应详细阅读说明书。剩余的活菌苗不可随意丢弃，应深埋或炉火烧掉。使用时，应将疫苗充分摇匀。使用前器具要严格消毒，注射时最好每注射一头家禽换一个针头。用过的疫苗瓶、器具、稀释后剩余的疫苗等污染物必须消毒处理。
严格和细心地进行注射操作。选用适合型号的针头，并调好注射器的松紧，避免疫苗液倒流造成数量不足，使免疫效果差。
注射疫苗的部位应用碘酒、酒精消毒，并防止消毒剂渗入针头或管内，以免影响疫苗活性，降低效果。
要将每一种疫（菌）苗的名称、编号、类型、规格、生产厂名的和有效期、批号，以及接种人员姓名和接种日期等详细登记在记录本上，方便以后抽查监测免疫效果。
消除影响疫苗接种效果的因素。对病态、体弱的猪暂不宜接种疫苗，待病愈或体质恢复后补注。注射疫苗时，有的猪会出现反应如体温升高、发抖、呕吐和减食等症状时，一般1至2天后可自行恢复，重者可注射肾上腺素。
在免疫接种前后10天内尽量不要用抗生素类药物，以免影响免疫效果。
