2017年，在湖南省登记在册的商品有机肥生产flshebei.cn企业共75家，年产能426万吨，可实际产量仅103万吨。“生产有机肥最好是就近获取原料，然而产业发展失衡导致区域布局不合理，有些地方畜牧业产量很大，但是有机肥生产滞后，两者未能协调发展。”邱伯根表示。
企业投资有机肥缺乏积极性主要有三难：首先是选址难，征地办证耗时费力；其次是赢利难，有机肥成本压不下来，售价提不上去；再其次是经营难，粪污发酵时间长，旺季制备和使用有机肥需要投入大量人力、物力，淡季则容易造成人力和设备闲置，给企业管理带来困扰。
在市场销售方面，有机肥也是处处受掣肘。从市场营销看，由于有机肥体量大，物流成本高，再加之有效期短，所以很难找到代理商，一般以厂家直销为主。从施用主体看，有机肥施用以种植大户为主，散户施用少；从施用对象看，以特色高效经济作物为主，大田作物比如水稻、玉米等较少。
有机肥有保水、固氮、抗寒、抗旱、抗冻、抗病等作用，但为什么使用面始终难以拓展？这主要有三方面原因：第一是农户不想用。因为有机肥肥效慢，需要3年~5年才能显现出土壤改良效果，且有机肥农产品优质，却不优价；第二是农户不敢用。有机肥产品优劣不一，再加上一些媒体和专家片面揣测其抗生素、重金属含量超标的影响，挫伤农户使用有机肥的信心；第三是农户用不起。有机肥价格高，且需要大量的人力物力，而农村青壮年大多进城务工，劳动力短缺。
在政策推力方面上，邱伯根认为，有机肥生产、销售及使用扶持政策不具体、不完善、可操作性不强，体制机制尚待健全。
