究其根本原因，主要是还在于：产业链中心环节过多。收集本身就费时费力，而回收成本太低，甚至不够收集耗费的成本；资源分散，难以成规模；处理设备投资大；国家政策补贴与税收减免活动覆盖面较小，要求门槛较高等等。
所以该如何应对这些问题，就需要由种植散户、养殖散户抱团发展。有机肥制作工艺中所需要的原料：粪便类、秸秆类、壳糠、糟渣、饼粕、污泥等，都是有机肥发酵生产中很好的原材料。既解决了养殖户们粪便污染的问题，也解决了种植户们秸秆还田难的问题。
如果我国有机废弃物资源得到有效利用，将产生巨大的环境效益。从大气环境的角度来说，每年至少可减少400亿立方米CO2的排放;从水环境的角度来说，每年至少减少向水环境排放2亿吨COD、650万吨氮素、250万吨磷素;从土地资源利用的角度来说，可减少约2万公顷(堆高5米)土地的占用，减少和避免有机固体废物对土壤的污染。
同时近两年来，由于过量施用化肥导致土壤盐渍化、板结等各种问题，也促有机肥的畅销,所以有不少的投资商开始规划生产有机肥。通过有机肥设备生产厂家，郑州程翔重工的负责人李经理告诉我们：他们安徽淮南的客户，本身并不养殖也不搞种植，全部的原材均是周遭的养殖户和种植户们主动拉到场内的，自己只负责设备投资，生产有机肥。这期间运输成本国家有政策补贴，生产的有机肥每吨补贴300元，现在有机肥价格可以卖到1200元，自己1~2年即可回本。每个地方的政府的优惠补贴政策有差异，有兴趣的可到各政府相关部门进行咨询。
创新农畜牧业生态循环模式，是实现“变废为宝”，将农畜牧业废弃物资源化利用是根本途径。
