口蹄疫疫苗在使用上容易产生误区：在技术规范上，注射部位不准确。应是肌内注射，不可注入脂肪层或皮下;针头与皮肤表面没有保持45°易造成肿块。剂量标准没有因品种、个体、营养水平的差异而适当调整，因而造成疫苗的过敏反应。
参考免疫程序：商品猪：40日龄、70日龄、出栏前1个月各防疫1次，使用合成肚疫苗或206佐剂灭活苗肌内注射或后海穴注射。后备母猪在配种前35天左右防疫。经产母猪和种公猪每年最少防疫3次。
注意事项：
1、疫苗应冷藏运输(但不能冷冻)或尽快运往使用地点，在运输和使用过程中都应避免阳光直接照射。
2、在使用疫苗前一定要先鉴别疫苗是否过期失效，效价是否够高，疫苗瓶是否有破损，如遇破乳或超过规定量分层1l/10的不能使用。
3、不能使用无标签、有破损、疫苗中有异物或变质的疫苗。
4、疫苗当天开启当天用完，使用时要摇匀。
5、注射器具和注射部位都应严格消毒，注意更换针头，保证每头猪一个针头，进针时应达到适当的深度(肌肉内)，以免影响疫苗效果。
6、接种前应对猪进行检查，患病、瘦弱、或临产母猪不宜注射。
7、接种疫苗时应从安全区到受威胁区，最后接种疫区内的安全群和受威胁群。
8、非疫区的猪接种1天后方可转移或调运。
9、接种时应严格遵守操作规程，接种人员在更换衣服、鞋帽、器具、必要消毒后方可参与疫苗接种。
10、接种时须有专人做好记录，写明数量、编号、栋舍、性别、年龄等，在安全区接种后观察7~10分钟，并详细地记录有关情况。
11、由于口蹄疫的特殊性，接种疫苗只是消灭和预防该病的多项措施之一，在接种疫苗的同时还应对疫区采取封锁、隔离、消毒等综合措施。
过敏反应及处理：
一般反应：表现为注射部位肿胀，体温升高，减食或停食1~2天，随着时间延长，反应逐渐减轻直至消失。
严重反应：因品种或个体差异，少数猪可能出现急性过敏反应(如焦躁不安、呼吸困难、肌肉震颤、口角出现白沫、鼻孔出血)，甚至因抢救不及时而死亡。部分妊娠母猪可能出现流产，建议及时使用肾上腺素等药物，同时采用适当的辅助疗法，减少损失。
