综合来看，通常发病原因主要有以下几方面。
首先是，虽然天气已经转凉了，并在向寒凉发展，但是养殖场主和饲养管理员的惯性思维，“本能”的降低了畜禽舍内的通风、清理、冲洗等频率。这便使得畜禽舍内的各种污染指数不同程度升高（见下表），特别是氨气的指数，不冲洗污染体的表面，是根本降不下来的。
表：这种污染指数的猪场发生呼吸道病是早晚的事
污染指标
发病猪舍(平均)
参数
结果
舍内地面
有积水
干燥不积水
不达标
舍内温度
19-22℃
25℃
不达标
舍内湿度
70%
60%
不达标
开启前后
窗的通风
0米/s
1.2-1.5m/s
不达标
舍内光照
20LXS
50 LXS
不达标
二氧化碳
1400ppm
650ppm
不达标
氨气浓度
30ppm
0～10ppm
不达标
硫化氢
3ppm
0ppm
不达标
PM2.5
140ppm
70-100ppm
不达标
饮水硬度
260ppm
100-190ppm
不达标
电解水质
重金属未见异常
无重金属污染
合格
水质安全
蔚蓝色，轻度水污染
洁净，无污染
不达标
新玉米
湿度15%，轻微霉变
干燥，无霉变
不达标
如此，在这种污染指数普遍超标的养殖环境中，受刺激的是猪的扁桃体，免疫力低的个体猪的扁桃体充血、发生咽炎，致使猪呼吸道疾病开发生、发展，乃至扩展到全群和临近猪舍。
其次是，饲料使用的新玉米二次成熟期未过，霉菌便在这个非常适宜的季节（温湿度），快速、大量繁殖致使玉米发霉，猪吃了这种霉菌污染的饲料就会诱发呼噜、咳喘、腹泻等呼吸道和消化道疾病。
再次就是，当前环境的昼夜温度差逐渐加大（＞10℃），特别是仔猪胃部食糜中的胃胰蛋白酶不能有效进行生物化合反应，从而导致畜禽消化不良的发生。
所以，根据发现的这些问题，对近期畜禽养殖管理方面的建议如下。
第一，基层养殖者必须有全群管理意识。可以针对性的应用一些功能性的中药添加剂，净化猪群血液原虫以维持大群的健康和稳定。特别是预防每年都防不胜防的秋老虎变化。
第二，畜禽发病的前兆多表现食欲减退。一旦发现畜禽减料，就说明体液失去了平衡，并依靠自身其胃动力恢复困难。使用一些补充体液方面的补液盐。
第三，对那些部分发热的猪，早期使用解表药。如对乙酰氨基酚双氯芬酸钠注射液；并平衡体液为主要治疗原则。若是遇见高烧、高死亡率，则绝大部分是细菌感染，就用一些高效的速效杀菌药，如硫酸头孢喹肟注射液。不要轻易思考其他因素。
一例育肥猪场的呼吸道病治疗医案
最近接到一个猪场病例，1000头育肥猪场；猪只平均体重60Kg，自由、粉料采食。接诊零星发热40.5±5℃，零星咳嗽不断，部分猪食欲不振，腹式呼吸，俯卧或犬坐姿势。泪癍超过2公分，部分眼睑潮红外翻，有咬架痕迹，部分毛色无光，皮肤消瘦，毛孔橙黄色分泌物。尿黄，粪便成型，色浅黑灰暗黏团装，消化不良。
发病后，即按照呼吸道疾病，用中药和西药治疗了一周。使用了麻杏石甘散、20%氟苯尼考粉、20%替米考星预混剂和30%阿莫西林可溶性粉等，自由采食投药，用药一周有余。用后反弹发热，注射解热药后低温，耳朵，皮肤颜色发绀，每一圈舍都有零星发病，减料30%。后来反而漫延发展，发病率在20%。
实验室血清学抗体检测未见明显漏洞，结合数码全血镜检，血清离心后溶血率在40%轻中度溶血，附着立克次氏体高繁殖，中性粒细胞未见异常，淋巴细胞未见异常增高，未见游离性的立克次氏体，红细胞破损率20%，红细胞色暗，大量叠联，轻度脱水。
综合上述信息后，初步诊断该猪群为继发性附红细胞体病。
治疗方案为，先禁食两天不喂饲料，补充体液。两天后饲喂，料中添加药物(按照正常剂量)。继续补充体液，同时拌料盐酸林可霉素可溶性粉、盐酸伯氨喹啉和消化酶。湿拌饲料、粥样集中一次喂给，一天一次，连用三天。
五天以后回访。猪群已经彻底切断传播途径，玉米更换，环境改善。无一病例伤亡，食欲恢复，粪便颜色恢复，精神状态良好，毛色明显泛光。
本病治疗小结。首先，对疾病的诊断，不能根据某种症状轻易下结论；要系统、专业论证主要病因在何处？虽然使用的各种药品都很好，但是请记住：发病期间，猪只不能自由采食。通过大群拌料、自由采食给药，通常是低效或无效的。
没有经验或没有经过实践，找不到特效药是治疗被动的原因之一。不限饲，找不到发病的猪是哪一头不吃料时，那么添加任何药都没有意义。所以说，方法比药物本身更重要。在疾病诊断中，应用相应专业检测仪器采集数据，四两拨千斤、事半功倍。因此，在事情搞未搞清楚之前，请不要给猪只乱投药。
