现今，养猪业所面对的是比以往更复杂的猪病，这种改变主要是由各种病毒的变异所引起，使我们要改变疾病控制的方法。
1病情正日趋复杂化
此复合症由病毒性病原体以各不相同的组合方式引发，而其它病原体相互影响，并且加重了此病的严重程度。
一个更为简单的例子是，爆发猪圆环病毒相关疾病(PCVD)的断奶仔猪继发感染沙门氏菌或大肠杆菌后引发腹泻，继发传染性胃肠炎很可能也会引发腹泻。还请记住，这些疾病不仅仅局限于生长猪群。繁殖障碍性疾病往往也是由多种病原体(如猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒和多种钩端螺旋体)较为复杂的协同感染引发。
2新病毒的演变
出现这种变化的主要原因是主要的新型病毒发生了演变。的确，以往也常常爆发猪传染性胃肠炎、猪细小病毒病，但它们往往以特定的发病方式爆发。我们现在遭遇的疾病是由许多可相互作用并且会对猪只产生根本性影响的病毒引发的。图1(猪呼吸道疾病复合症图解)列出了这些病毒中的多种病毒，但起主导作用的是猪繁殖与呼吸综合征病毒Porcine Reproductive and Respiratory SyndromeVires，PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和高致病性猪流感病毒(Swine Influenza Virus，sir)。另外，猪圆环病毒相关病中假设的x因素是否是病毒仍存在疑问。
这些新型病毒的其中一个特征是，它们不仅自己能够引起猪发病，而且还会通过干扰猪的兔疫系统促使其它病原体引起猪只爆发另外的疾病。它们甚至会影响到一些已用于控制疾病的常规预防措施。例如，研究表明猪猪圆环病毒2型感染会妨碍猪繁殖与呼吸综合征病毒疫苗产生有效的免疫作用。
复杂的综合征发病增多还存在其它的诱因，如采用大群体饲养模式、高密度饲养方式和猪只移动更频繁。另外，生产经营往往处于较高的经济压力之下，因此管理措施可能因此受到影响，即每个饲养批次之间的清洗和消毒被省去。除上述因素外，还有其它重要因素导致了猪病的发病状况发生了改变，但是，究其根本仍是病毒。单纯的疾病似乎能够轻易地控制，而现代复杂的疾病却不行。当前，有使用高剂量抗生素进行控制的趋势，但是抗生素对病毒的作用微乎其微，并且有研究表明它们会对免疫系统造成不良影响。因此，我们必须改变疾病控制方法。
3疾病控制的难点
像以往一样，防控的最好办法是尽可能地使猪群远离这些病原体。首先，引进无猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪肺炎支原体的繁育猪;然后，可以通过免疫接种来防控主要的病原体(如猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪猪圆环病毒2型);其次，利用隔离饲养系统以减少可能残留的病原体对猪群的影响。连续饲养系统只会使疾病更加严重。
